Karaköy Güllüoğlu, GDO başvurularına ilişkin tepkisini göstermek için Türkiye Gıda ve İçecek Sanayii Dernekleri Federasyonu (TGDF) ile bağlarını kopardı.
Gıda amaçlı 29 adet GDO'nun ithalatı için 28 Ekim 2010 tarihinde Biyogüvenlik Kurulu'na başvuran TGDF'nin bir bileşeni olan Şekerli Mamül Sanayicileri Derneği'nin (Şemad) üyesi olan Karaköy Güllüoğlu, bu dernekten üyeliğini çekti. Güllüoğlu, ürünlerinde hiçbir zaman GDO'lu ürün kullanılmadığını, bundan sonra da kullanılmayacağını duyurdu.

Karaköy Güllüoğlu'nun Şemad'a yaptığı üyelik iptali başvurusunda aşağıdaki ifadelere yer verildi: "İki asırlık tarihi bir firma olarak bizim için en başta tüketici sağlığı ön plandadır. Tüketici sağlığını hiçe sayan hiçbir kurum ile işbirliği yapmak saygın kimliğimize yakışmaz. Ürünlerimizde hiçbir şekilde GDO içermemektedir. Aksine piyasada glikoz şurubunu önlemek için yıllarca emek verip ARGE'sini yaptığımız ve sadece pancardan elde edilen invert şeker kullanmaktayız. Dernek olmanın ana prensiplerinden birisi de kamu yararına işler yapmaktır. Gördüğümüz kadarıyla Şemad Derneği bu durumda ticari düşünmektedir. Dernek ilkesinden sapmıştır."

Karaköy Güllüoğlu'nun kararını örnek bir adım olarak nitelendiren Greenpeace Akdeniz Tarım Kampanyası Sorumlusu Tarık Nejat Dinç, "Karaköy Güllüoğlu'nun bu kararı, tüketicinin sağlığını ön planda tuttukları konusunda samimi olduklarını gösteren, örnek bir karardır. Geçtiğimiz haftalarda Türkiye çapında yaptırdığımız kapsamlı araştırma, halkın yüzde 80'inin GDO ithalatı yapmak için başvuru yapan bir firmaya güvenmeyeceğini ortaya koyuyor. Karaköy Güllüoğlu, GDO ithalatı için başvuran TGDF ile ilişkisini keserek, GDO ve TGDF'ye tepkisini gösteren ilk firma oldu ve tüm Türkiye'nin güvenini kazandı. Bu karar, TGDF üyesi diğer büyük markalar için de bir örnek oluşturmalıdır. Türkiye'nin önde gelen firmaları, TGDF'den talep ederek GDO başvurularının geri çekilmesini sağlayacak güce sahip" dedi.